Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap23O09044 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap23O09044 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms