Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa3O09000 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa3O09000 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms