Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barx2O08686 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barx2O08686 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barx2O08686 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms