Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf6O08584 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf6O08584 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf6O08584 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms