Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec22bO08547 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms