Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms