Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21897J3KMP5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms