Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms