Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp6G5E8P0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms