Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh19G5E8H9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms