Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdelc2G5E897 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kdelc2G5E897 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms