Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms