Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgxb3G3X9M3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms