Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms