Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms