Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms