Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp17lbE9Q9U0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms