Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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