Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700024B05RikE9Q6D7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms