Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85cE9Q6B2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms