Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Susd1E9Q3H4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms