Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp1E9Q368 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp1E9Q368 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms