Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2U8

Gm20721, Predicted gene, 20721, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20721E9Q2U8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20721E9Q2U8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms