Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc171E9Q1U1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms