Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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Gm3893E9Q1I1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3893E9Q1I1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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