Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms