Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms