Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms