Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms