Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms