Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph10bE9PYQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms