Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms