Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsf1E9PWW9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsf1E9PWW9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsf1E9PWW9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms