Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col6a3E9PWQ3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col6a3E9PWQ3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms