Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms