Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5478D3Z6R0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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