Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms