Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12cD3Z3L3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms