Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms