Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms