Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms