Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd1D3YXK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samd1D3YXK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms