Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm7257D3YX25 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms