Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam47eD3YWC7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam47eD3YWC7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms