Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms