Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26c1B2RXA7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26c1B2RXA7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms