Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfap58B2RW38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms