Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Abcc8B2RUS7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Abcc8B2RUS7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc8B2RUS7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms