Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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