Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apba1B2RUJ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms